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Text File  |  1995-03-04  |  2.2 KB  |  43 lines
  1. **********************************************************
  2. * Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductases signatures *
  3. **********************************************************
  4.  
  5. Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase  (EC 1.1.1.34)  (HMG-CoA reductase)
  6. [1,2] catalyzes the NADP-dependent  synthesis  of mevalonate from 3-hydroxy-3-
  7. methylglutaryl-CoA.   In vertebrates, HMG-CoA  reductase  is the rate-limiting
  8. enzyme in  the  biosynthesis of  cholesterol.  In  plants,  mevalonate  is the
  9. precursor of all isoprenoids compounds
  10.  
  11. HMG-CoA reductase  is a membrane bound enzyme.  Structurally  it consists of 3
  12. domains: a  N-terminal region that contains a variable number of transmembrane
  13. segments (7 in mammals, insects, and fungi; 2 in plants), a linker region, and
  14. a C-terminal catalytic domain of approximately 400 amino acid residues.
  15.  
  16. Some bacteria, such  as Pseudomonas mevalonii, can  use mevalonate as the sole
  17. carbon source. These bacteria use a NAD-dependent HMG-CoA reductase (EC 1.1.1.
  18. 88) to  deacetylate  mevalonate into  3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA [3].  The
  19. Pseudomonas enzyme is structurally  related  to  the catalytic domain of NADP-
  20. dependent HMG-CoA reductases.
  21.  
  22. We have  selected  two  conserved  regions  as  signature patterns for HMG-CoA
  23. reductases.  The  first one is  located in the center of the catalytic domain,
  24. while  the  second  one is a  glycine-rich  region  located in  the C-terminal
  25. section of that domain
  26.  
  27. -Consensus pattern: [RKH]-x(6)-D-x-M-G-x-N-x-[LIVM]
  28. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  29. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Alcaligenes eutrophus plasmid  pJP4
  30.  2,4-dichlorophenol hydroxylase (tfdB) and phage T4 protein GP27.
  31.  
  32. -Consensus pattern: [LIVM]-G-x-[LIVM]-G-G-[AG]-T
  33. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  34. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: Streptococcus pneumoniae amiC.
  35. -Last update: December 1992 / Text revised.
  36.  
  37. [ 1] Caelles C., Ferrer A., Balcells L., Hegardt F.G., Boronat A.
  38.      Plant Mol. Biol. 13:627-638(1989).
  39. [ 2] Basson M.E., Thorsness M., Finer-Moore J., Stroud R.M., Rine J.
  40.      Mol. Cell. Biol. 8:3797-3808(1988).
  41. [ 3] Beach M.J., Rodwell V.W.
  42.      J. Bacteriol. 171:2994-3001(1989).
  43.